伊丽莎白·A·爱德华兹

伊丽莎白·爱德华兹大学教授
工学学士,工学硕士(麦吉尔),博士。(斯坦福大学),P.Eng。
加拿大厌氧生物技术研究主席
首席调查员
,Biodegraders研究小组
经理,BioZone–应用生物科学和生物工程中心
交叉任命教授,细胞与系统生物学系房间:WB420D |电话:416-946-3506 |邮箱:伊丽莎白。edwards@utoronto.ca

奖品

  • 官员,加拿大法令,2020年
  • 基勒姆工程奖;加拿大艺术委员会,2016年
  • 2014年,加拿大厌氧生物技术研究主席(一级)
  • 加拿大皇家学会会员,2012年
  • 2011年加拿大工程院院士
  • 研究员,AAAS 2011
  • 基拉姆研究奖学金,2008-2010年

会员资格

  • 安大略省专业工程师(PEO)
  • 环境工程与科学教授协会
  • 美国微生物学会(ASM)
  • 美国化学学会(ACS)

研究兴趣

厌氧微生物群落分析

这是基础和应用环境微生物学中非常激动人心的时刻,因为用于研究复杂生物系统的分析工具和技术的最新进展。这些工具包括负担得起的大规模测序、定量DNA和RNA提取和扩增工具,以及适用于复杂混合物和小样本的蛋白质组学分析。这些技术使新方法能够揭示具有全球重要性的复杂微生物系统中的基本代谢、调节、遗传学和种间代谢产物转移,如营养循环、废水处理和人类微生物组。与我自己的研究相关的具体应用包括生物甲烷生产、废水处理、土壤和地下水生物修复。这些过程依赖于复杂的微生物群落,而这些微生物群落违背了传统的还原论微生物方法。我的研究小组积极参与研究,以了解复杂微生物群落中的功能相互作用,以及这些相互作用如何使整体的活动比单个部分的总和大得多。我们还非常积极地将这些知识转化为实践,特别是在生物修复领域。

生物降解、生物转化和生物修复

我的研究小组致力于了解生物过程如何影响环境中污染物的命运。我们运用分析化学、分子生物学、微生物学、酶学、环境基因组学和蛋白质组学等多种技术,结合质量和能量平衡方法,对复杂的微生物过程,尤其是厌氧环境中的微生物过程进行分解和建模。

单芳烃(如苯、甲苯和二甲苯)是常见的地下水污染物,因为它们存在于大多数石油产品中。这些化合物可以在各种不同的条件下进行有氧和厌氧生物降解。厌氧工艺在原位生物修复(即地下就地生物修复)方面比好氧工艺具有显著优势,因为厌氧工艺不受氧气可用性的限制。我的研究探索了影响厌氧环境中单芳烃命运的生物过程,包括催化这些反应的微生物的详细特征及其在现场修复中的潜在作用。

氯化溶剂是所有工业化地区普遍存在的地下水污染物。这些溶剂被广泛地用作脱脂剂和干洗。在氧的存在下,这些化合物很稳定。然而,在还原条件下,它们易受连续脱氯的影响,最终产生非氯化(无毒)产品。环境中自然存在的微生物负责许多氯化溶剂的还原性脱卤。我的实验室一直积极致力于将这些知识转化为生物修复的实践,特别是生物增强,利用这些迷人的厌氧微生物的独特代谢,“呼吸”氯化溶剂。

工业和城市垃圾的厌氧消化

有机废物的厌氧消化具有巨大的潜力,可以解决大多数工业和市政当局面临的经济和环境压力。虽然厌氧消化已广泛应用于某些部门,但人们对将其应用于新的废物流,例如纸浆和造纸工业,有着浓厚的兴趣。利用预处理方法和反应器配置的组合,结合新的分子和分析工具来获得厌氧过程的机械信息,我们正在研究从废液和固体流中回收能源的替代方法。

论著

王,P-H.,科雷亚,K.,何,H-C.,维纳亚克,N.,内默,K.,弗利克,R.,马哈德万,R.和E.A.爱德华兹。2018“种间苹果酸-丙酮酸穿梭驱动有机卤化物呼吸微生物群落中的氨基酸交换。”bioRxiv。冷泉港实验室,379438.118。

Molenda, O., Tang, S., Lomheim, L. and E. A. Edwards. 2018。8个新的有机卤化物呼吸型脱卤球菌基因组揭示了还原脱卤酶的进化趋势。bioRxiv。冷泉港实验室,345173。

Molenda, O., Tang, S., Lomheim, L., Guatam, V., Lemak, S., Yakunin, a.f., Maxwell, K.L. and E.A. Edwards. 2018。在dehalococcus mccartyi中,CRISPR-Cas靶向的染色体外环状元件与还原脱卤酶基因的动员有关。ISME杂志,8月。施普林格我们,保护主义。doi: 10.1038 / s41396 - 018 - 0254 - 2。

王、林志信;Khusnutdinova, a;罗,f;肖,j .;Nemr k;电影,r;布朗,g;马哈德文,r;爱德华·e·a·;亚库宁,A. F.,纯化戊烯酰化FMN细胞化学生物学2018的生物合成和生化活性doi: 10.1016/j.chembiol.2018.02.007。

Bonilla,S.,Choolaei,Z.,Meyer,T.,Edwards,E.A.,Yakunin,A.F.,Allen,D.G.2018评估酶预处理对纸浆和纸张生物污泥厌氧消化率的影响。生物技术报告。17:77-85.

乔,W.,罗,F.,洛姆海姆,L.,麦克,E.,叶,S.,吴,J.和爱德华兹,E.A.2018年。根据现场调查和微观研究推断,氯苯污染工业现场的自然衰减和厌氧苯脱毒过程。环境科学与技术。52(1):22-31

佩雷斯·德莫拉,A。;拉考特,A。;麦克马斯特,M.L。;梁,X,。;德沃拉泽克,S。;爱德华兹,E.A.,2017年。在脱氯富集培养物和地下水中,氯化电子受体的有效性选择了特定的类脱卤球菌种群。生物十四。doi.org/10.1101/175182;微生物学前沿9(5月):968-914。内政部:10.3389/fmicb.2018.00812。

Telling, J., Voglesonger, K., Sutcliffe, C., Lacrampe-Couloume, G., Edwards, E. and Lollar, B.S. 2017。前寒武纪地壳深部断裂流体微生物氢利用的生物能量约束地球微生物学杂志。108 - 119。

王,M.T.,王,W.,Couturier,M.,Razeq,F.M.,Lombard,V.,Lapebie,P.,Edwards,E.A.,Terrapon,N.,Henrissat,B.和Master,E.2017年。长期富集后加拿大海狸(Castor canadensis)和北美驼鹿(Alces americanus)肠道菌群中纤维素和杨树水解物降解微生物富集物的比较宏基因组学研究。微生物学的前沿。8:2504.

Puentes Jacome,L.A.和Edwards,E.A.2017年。在已建立的以脱卤球菌为主的氯乙烯脱氯富集培养基中,氯化底物的切换导致出现先前未检测到的天然脱卤杆菌种群。FEMS微生态晶体。93(12):131. 内政部:10.1093/femsec/fix141。

Yan, J., Bi, M., Bourdon, A.K., Farmer, A.T., Wang, p.h., Molenda, O., Quaile, A., Jiang, N., Yang, Y., Yin, Y., Simsir, B., Campagna, S.R, Edwards, E.A and Löffler, F.E., 2018 Purinyl-cobamide是还原脱卤素酶的天然基。自然化学生物学。14:8-14 doi:10.1038/nchembio.2512

Garg,S.,Judd,K.,Mahadevan,R.,Edwards,E.和Papangelakis,V.2017。安大略省萨德伯里地区含镍磁黄铁矿尾矿的浸出特性。加拿大冶金季刊。56(4):372-381.

Garg,S.,Papangelakis,V.,Edwards,E.,和Mahadevan,R.,2017年。应用选择性溶解方案量化磁黄铁矿尾矿中磁黄铁矿和镍黄铁矿的最终溶解程度。国际矿物加工杂志。158: 27–34.

翟伟,王明涛,罗芳,哈什米,明志,刘旭,Edwards E. A.,唐昕,徐杰。2017。堆肥中砷的甲基化及其与arsM基因丰度和多样性的关系科学Reports.4:2198。

梅耶·布莱克威尔,K.,芬克,M.,莫伦达,O.,卡拉汉,B.,休厄尔,何,霍姆斯,S.,爱德华兹,E.和斯波曼,A.2017年。1,2-二氯乙烷暴露改变了三氯乙烯脱氯的麦卡锡脱卤球菌群的种群结构、代谢和动力学。环境科学与技术。50(22):12187-12196.

梅耶,T.,H.N.陈,D.G.艾伦和E.A.爱德华兹。2017自然冻融及其对生物污泥脱水性和厌氧消化率的影响。环境工程科学。34(5):357-366.

王,P-H.,唐,S.,内默,K.,弗利克,R.,燕,J.,马哈德凡,R.,亚库宁,A.,洛夫勒F.L.和E.A.爱德华兹。2017精细的实验注释揭示了氯仿呼吸的脱卤杆菌分离物中保守的Corrinoid自养。ISME杂志。11(3):626-640.

Molenda, O., Tang S. and E.A. Edwards. 2016。对氯乙烯具有厌氧还原脱氯能力的麦卡特尼脱卤菌WBC-2的全基因组序列。基因组公告。4 (6):e01375-16

Schnurr, P., Molenda, O., Edwards, E.A., Espie, G.S.和Grant Allen. 2016。通过光子通量密度与CO2浓度的协同作用提高藻类生物膜的生物量生产力。生物资源技术219:72 - 79。

Kocur, C., Lomheim, L., Molenda, O., Weber, K., Austrins, L., Sleep, B., Boparai, H., Edwards, E.A., O 'Carroll, D. 2016。羧甲基纤维素稳定纳米级零价铁注射后微生物群落和脱氯活性的长期现场研究。环境科学与技术。50(14):7658-7670。

王,M.T.,W.Wang,M.Lacourt,M.Couturier,E.A.Edwards和E.Master。2016基质驱动的木质纤维素中微生物群落的聚合——加拿大海狸(Castor Canadensis)和北美驼鹿(Alces Americanus)肠道微生物区系的改良富集物。微生物学的前沿。7:961.

Mahbod,H.,Nocek,B.P.,Tchigvintsev,A.,Brown,G.,Flick,R.,Xu,X.,Cui,H.,Hai,T.,Joachimiak,A.,Golyshin,P.N.,Savchenko,A.,Edwards,E.A.和Yakunin,A.F.2016年。微生物羧酸酯酶酶解聚乳酸和其他聚酯的生化和结构研究。生物大分子。17(6):2027-2039

Meyer,T.,Yang,M.I.,Allen,D.G.,Tran,H.N.和爱德华兹,E.A.2016年。树脂和脂肪酸对纸浆和造纸厂废水全面厌氧处理的影响。环境工程科学33(6):394-403。

唐,S.王宝祥,希金斯,SA,佛罗里达州勒夫勒和E.A.爱德华兹。2016姐妹脱卤杆菌基因组揭示了有机卤化物呼吸的特化和最近可能由氯化底物驱动的菌株分化。微生物学前沿,12(7):100。

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